RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.65□□□□□ -0.71
PDGFRB-201ENST00000261799 NXPH4O95158 308 aa10.64□□□□□ -0.71
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PDGFRB-201ENST00000261799 SFTA2Q6UW10 78 aa10.64□□□□□ -0.71
PDGFRB-201ENST00000261799 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
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PDGFRB-201ENST00000261799 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.6□□□□□ -0.71
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PDGFRB-201ENST00000261799 ESM1Q9NQ30 184 aa10.57□□□□□ -0.72
PDGFRB-201ENST00000261799 C20orf78Q9BR46 151 aa10.56□□□□□ -0.72
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PDGFRB-201ENST00000261799 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.55□□□□□ -0.72
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PDGFRB-201ENST00000261799 FXYD5Q96DB9 178 aa10.55□□□□□ -0.72
PDGFRB-201ENST00000261799 C2orf82Q6UX34 121 aa10.55□□□□□ -0.72
PDGFRB-201ENST00000261799 COX7A2LO14548 114 aa10.55□□□□□ -0.72
PDGFRB-201ENST00000261799 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PDGFRB-201ENST00000261799 GAGE2EQ4V326 116 aa10.55□□□□□ -0.72
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PDGFRB-201ENST00000261799 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.55□□□□□ -0.72
PDGFRB-201ENST00000261799 SPINK8P0C7L1 97 aa10.55□□□□□ -0.72
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