RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 C11orf52Q96A22 123 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 CARD19Q96LW7 228 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 SYNJ2BPP57105 145 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 RNF5Q99942 180 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 WIPF3A6NGB9 483 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 THBDP07204 575 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 ACACBO00763 2458 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.2□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 UBL5Q9BZL1 73 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 C1orf159Q96HA4 380 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 HLA-DMBP28068 263 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 HTN3P15516 51 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 SIVA1O15304 175 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 C12orf74Q32Q52 190 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.19□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 LRP4O75096 1905 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 ZNF524Q96C55 264 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 G3V4G9 280 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 FXYD5Q96DB9 178 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 INSP01308 110 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TMEM141Q96I45 108 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 DKK2Q9UBU2 259 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 NDUFS7O75251 213 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 HERV-K104P63124 156 aa8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 F8VRH5 84 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 LMO1P25800 156 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 C5orf47Q569G3 176 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 NUPR1O60356 82 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 MUC4Q99102 2169 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TMEM243Q9BU79 118 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 HAMPP81172 84 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 PCP2Q8IVA1 136 aa8.17□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 HLA-DRB4P13762 266 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 PRB1P04280 392 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TAL2Q16559 108 aa8.16□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 M0R1W7 72 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 OOSP1A8MZH6 123 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 DKK1O94907 266 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 NPYP01303 97 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 WFDC2Q14508 124 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 WDR86Q86TI4 376 aa8.15□□□□□ -1.1
TTL-201ENST00000233336 PRR25Q96S07 402 aa8.15□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 CDK2AP2O75956 126 aa8.15□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 IGLC1P0CG04 106 aa8.15□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 MDS2Q8NDY4 140 aa8.15□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 WT1-ASQ06250 92 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 SHISA9B4DS77 424 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 LTAP01374 205 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 EFNA4P52798 201 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GX51 115 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 I3L3M4 83 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 CACNA1AO00555 2505 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 FAM223BA6NKX1 122 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 DTX1Q86Y01 620 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.14□□□□□ -1.11
TTL-201ENST00000233336 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms