RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 SEM1Q6ZVN7 128 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 PRTN3P24158 256 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 Q6ZUT4 128 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 A0A087WX48 190 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 B5MCH6 92 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM178BH3BS89 294 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 NFE4Q86UQ8 179 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 ZMAT4Q9H898 229 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 KALRNO60229 2985 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 MFAP4P55083 255 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 PRO0461Q9UI25 63 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-201ENST00000007722 LINC01548A6NM66 108 aa10.21□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 SHISA9B4DS77 424 aa10.21□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 KIR2DL4Q99706 377 aa10.21□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 NBASA2RRP1 2371 aa10.21□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 A6NJY4 79 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TAL2Q16559 108 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 CFHR4Q92496 578 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 PRAC2D3DTV9 90 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TIMM23O14925 209 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 MGPP08493 103 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 IGLC6P0CF74 106 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 PLNP26678 52 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 C1orf210Q8IVY1 113 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 LINC00311Q8N616 119 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 CDIP1Q9H305 208 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 H7C1H1 209 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 SLC25A16P16260 332 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 KLRD1Q13241 179 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 M0R381 172 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TEX29Q8N6K0 151 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 ABCA4P78363 2273 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 FAM90A27PA6NNH2 459 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 CEACAM4O75871 244 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 ADIPOQQ15848 244 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 BSPH1Q075Z2 132 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 PIFOQ8TCI5 191 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 C21orf62Q9NYP8 219 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 F8VRH5 84 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 PDE6HQ13956 83 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 ZFAND6Q6FIF0 208 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TECTAO75443 2155 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TACC2O95359 2948 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 A8MWV9 139 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 PPDPFLQ8WWR9 84 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 RAB1BQ9H0U4 201 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 FHL3Q13643 280 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 TSPAN13O95857 204 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 CRYGBP07316 175 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 ACACAQ13085 2346 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 Q1RN00 199 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 Q6ZQT7 251 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 RAX2Q96IS3 184 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 VSTM5A8MXK1 200 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 ERG28Q9UKR5 140 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 FAM215AQ9Y5M1 114 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-201ENST00000007722 MUC6Q6W4X9 2439 aa10.15□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 NBR2O15453 112 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 TCL1BO95988 128 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 CARD19Q96LW7 228 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 APC2O95996 2303 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF688P0C7X2 276 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 DLX6P56179 175 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-201ENST00000007722 LINC01559Q495D7 138 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms