RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r5B2RQT2 315 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spsb3Q571F5 354 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r211Q8R266 298 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r222Q8R269 308 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mpped1Q91ZG2 326 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tlnrd1Q9ERE8 362 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tsga8Q9JJL0 238 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Elovl1Q9JLJ5 279 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hsd17b6Q9R092 317 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Osr1Q9WVG7 266 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abca2P41234 2434 aa12.91□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmsb15aA2AEH9 79 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Inafm1E9PV59 130 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm8677K9J7G9 307 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Chek1O35280 476 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 P01803 113 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rpl8P62918 257 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Defb2P82020 71 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm648Q3UJ22 213 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr147Q60886 317 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 AtraidQ6PGD0 223 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 SbsnQ8CIT9 700 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pygo1Q9D0P5 417 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fkbp11Q9D1M7 201 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arpc5lQ9D898 153 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Col7a1Q63870 2944 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr39E9PVX1 319 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm10037E9PX85 104 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Esp8F7AMQ8 149 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cldn34c3J3QJW5 233 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cldn34c2J3QNM1 233 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r128L7N2B4 307 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 B2mP01887 119 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ube2e1P52482 193 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mmp28Q8CGV8 520 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cldn34c1Q8K193 234 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 FibinQ9CQS3 217 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hint2Q9D0S9 163 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam96bQ9D187 163 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ap5s1Q9D742 170 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 CutcQ9D8X1 272 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fgf16Q9ESL8 207 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hivep2Q3UHF7 2430 aa12.9□□□□□ -0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm6904E9PVF1 202 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hyal2O35632 473 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem95P0DJF3 176 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sssca1P56873 199 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm9913Q8BQQ2 135 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Iba57Q8CAK1 358 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 0610009B22RikQ8R3W2 140 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr368Q8VF22 327 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 B3gnt9Q8VI16 399 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 HeylQ9DBX7 326 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 GlrxQ9QUH0 107 aa12.89□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr284A0A0U1RP76 321 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm17333C6EQI3 125 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr893K7N678 312 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd3eP22646 189 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam3dP97805 223 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q6PIU9 354 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnd1Q6VY05 352 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp273Q7M6W8 501 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r226Q8R2A8 298 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gins3Q9CY94 216 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mrpl30Q9D7N6 160 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp119aQ9JIC0 545 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Chst4Q9R1I1 388 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc22a5Q9Z0E8 557 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Angptl4Q9Z1P8 410 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1458A0A1L1SSD5 307 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 ApcsP12246 224 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pax2P32114 414 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dhrs2Q149L0 282 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1178Q7TR20 323 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr138Q7TRI7 312 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4894Q8CA09 118 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 GaptQ8CB93 157 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr786Q8VFH8 312 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1155Q8VFR3 314 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1444Q8VFX2 319 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr513Q8VFZ3 309 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr482Q8VG03 323 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mogat1Q91ZV4 335 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Med28Q920D3 178 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rnf141Q99MB7 230 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930583I09RikQ9D2E3 102 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plekha2Q9ERS5 425 aa12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eny2Q9JIX0 101 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdc34bA0A140T8I4 237 aa12.87□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 AsmtD3KU66 387 aa12.87□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm5239D3YYZ2 122 aa12.87□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cxcl2P10889 100 aa12.87□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Npy1rQ04573 382 aa12.87□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smco3Q8BQM7 225 aa12.87□□□□□ -0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 TdhQ8K3F7 373 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms