RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635614.1

CD55-211, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), humanhuman

TSL 5

Gene CD55, Length 1,145 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55-211ENST00000635614 GAGE12BA1L429 117 aa7.42□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.42□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 TAS2R45P59539 299 aa7.42□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.42□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 CBY3A6NI87 242 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 SIX6O95475 246 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 MPC2O95563 127 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 NMBP08949 121 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 HTN1P15515 57 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 HOXA5P20719 270 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 CSN1S1P47710 185 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 IFITM3Q01628 133 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 CLINT1Q14677 625 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 RNF212Q495C1 297 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 BAP18Q8IXM2 172 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 THAP6Q8TBB0 222 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 ASB13Q8WXK3 278 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 ATP5SQ99766 215 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 OR51M1Q9H341 326 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 RYR3Q15413 4870 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 LYSTQ99698 3801 aa7.41□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 SNURFLB1AK76 121 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 H3BQ15 152 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 PTTG1O95997 202 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 ATP5G1P05496 136 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 HTN3P15516 51 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 ATP5G3P48201 142 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 HSPB11Q9Y547 144 aa7.4□□□□□ -1.22
CD55-211ENST00000635614 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 SLC17A3O00476 420 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 H2BFSP57053 126 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 KHDC3LQ587J8 217 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 MORN5Q5VZ52 161 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 PAXXQ9BUH6 204 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 FUT9Q9Y231 359 aa7.39□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 A0A1W2PPV4 95 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 F5H697 171 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 TRIAP1O43715 76 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 OR7C2O60412 319 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 DEFB130BP0DP73 79 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 DEFB130AP0DP74 79 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 ZNF266Q14584 549 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 BLNKQ8WV28 456 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 ATG101Q9BSB4 218 aa7.38□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 RBAKDNA6NC62 111 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 F5H768 121 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 H0YIZ8 118 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 H3BTX0 84 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 GPX1P07203 203 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 CT45A10P0DMU9 189 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 MED28Q9H204 178 aa7.37□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 C7orf71A4D174 169 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 TNFRSF6BO95407 300 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 MBP02144 154 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 PYYP10082 97 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 CCL18P55774 89 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 MBD2Q9UBB5 411 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.36□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.35□□□□□ -1.23
CD55-211ENST00000635614 KLLNB2CW77 178 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms