RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589706.1

SMAD4-208, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-208	ENST00000589706	MPDU1	O75352	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	OR2H2	O95918	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	NGF	P01138	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHM	P01871	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ATP5G1	P05496	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CRYGD	P07320	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CPM	P14384	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF823	P16415	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CCL1	P22362	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	GLRX	P35754	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ATP5G3	P48201	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	EMP1	P54849	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PIGC	Q92535	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RASL10A	Q92737	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	COX14	Q96I36	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM60A	Q9NP50	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A0U1RRA0	63 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		K7EN84	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SCT	P09683	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CSN1S1	P47710	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	UTF1	Q5T230	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	GAPT	Q8N292	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LINC01587	Q99440	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ANK2	Q01484	3957 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		H3BSH0	61 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	NPFF	O15130	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	FXYD4	P59646	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		M0R2P5	195 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	RS1	O15537	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	LMX1B	O60663	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	NDUFA7	O95182	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	CRYAA	P02489	173 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	INSL3	P51460	131 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	SEC61G	P60059	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMAD4-208	ENST00000589706	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69

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