RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	HSD52	Q0P140	79 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CSNK1D-222	ENST00000584377	EBI3	Q14213	229 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CSNK1D-222	ENST00000584377	KIR3DS1	Q14943	382 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CSNK1D-222	ENST00000584377	CHEK1	O14757	476 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CSNK1D-222	ENST00000584377	RAB37	Q96AX2	223 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CSNK1D-222	ENST00000584377	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR5AL1	P0C617	328 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	PDE6H	Q13956	83 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1W2PPM0	123 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	RAB9A	P51151	201 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	LY6D	Q14210	128 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	LINC01545	Q5VT33	79 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	RABAC1	Q9UI14	185 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	HAX1	O00165	279 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM106CP	P0CH98	169 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	AKAP6	Q13023	2319 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	FGF6	P10767	208 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF138	P52744	262 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1B0GUT8	65 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	SCGB2A1	O75556	95 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377		Q8N9W7	124 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	CTSG	P08311	255 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	CSN1S1	P47710	185 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	CRIP1	P50238	77 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	OVOL3	O00110	214 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	EFNA4	P52798	201 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	CKS1B	P61024	79 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	UBE2E1	P51965	193 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	C8orf49	Q96NF6	230 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	FABP2	P12104	132 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	CRYBA4	P53673	196 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	RIG	Q13278	110 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	TPPP3	Q9BW30	176 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	SAA4	P35542	130 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377		Q6AWC8	147 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	AJUBA	Q96IF1	538 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	NCR2	O95944	276 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	C15orf32	Q32M92	178 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CSNK1D-222	ENST00000584377	LMO4	P61968	165 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1B0GW15	77 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377		A1L4Q6	167 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF747	Q9BV97	191 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	ITPR1	Q14643	2758 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	CSN3	P07498	182 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	DPF1	Q92782	380 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	SH2D1A	O60880	128 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	TCTA	P57738	103 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	GATD1	Q8NB37	220 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	CLEC3B	P05452	202 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRR25	Q96S07	402 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPATA25	Q9BR10	227 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377		Q8TAT8	98 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CSNK1D-222	ENST00000584377		G3V318	75 aa		10.24	□□□□□ -0.77

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