RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579358.1

MKS1-208, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 4

Gene MKS1, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-208ENST00000579358 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 RRN3P1Q2M238 152 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 SSX7Q7RTT5 188 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 STOML3Q8TAV4 291 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 PGPA6NDG6 321 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 NUPR2A6NF83 97 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 KLLNB2CW77 178 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 DIRC3C9JPN6 131 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 NMBP08949 121 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 CRISP2P16562 243 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TAS2R60P59551 318 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 ERCC8Q13216 396 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TMED6Q8WW62 240 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 ZNF492Q9P255 531 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 AGRNO00468 2067 aa7.22□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 A0A1W2PRE2 83 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 CXorf65A6NEN9 183 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 H7BYZ3 331 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 ZNF138P52744 262 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 VGLL1Q99990 258 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.21□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 C7orf71A4D174 169 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 GGTLC3B5MD39 225 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 PMS2P11Q13670 270 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 KIR3DS1Q14943 382 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 ZFP69Q49AA0 526 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 SLC51BQ86UW2 128 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 C16orf74Q96GX8 76 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 FAM210AQ96ND0 272 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 LINC01587Q99440 93 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 CELA1Q9UNI1 258 aa7.2□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 A0A1B0GVG6 124 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 C11orf94C9JXX5 98 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 J3KRW8 73 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 TCRAP04437 139 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 FHITP49789 147 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 RAB5CP51148 216 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 Q8TAT8 98 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 DKK2Q9UBU2 259 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.19□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 A6NJY4 79 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 LYRM9A8MSI8 78 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 K7EQM0 130 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 GPX1P07203 203 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 EMP1P54849 157 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 GNG5P63218 68 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 CD300CQ08708 224 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 BTN1A1Q13410 526 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 Q6ZTC4 211 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 ATG101Q9BSB4 218 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 EPDR1Q9UM22 224 aa7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MKS1-208ENST00000579358 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms