RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.55□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 NFE4Q86UQ8 179 aa7.55□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.55□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00477Q96M19 166 aa7.55□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 VGLL1Q99990 258 aa7.55□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.55□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 PRO0255Q9UI72 69 aa7.55□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.55□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 K7EP13 123 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 PAX4O43316 350 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 SCGB1D2O95969 90 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 ERCC8Q13216 396 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 FHL2Q14192 279 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 PRR9Q5T870 116 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 Q6ZRG5 221 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 PRELID1Q9Y255 219 aa7.54□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 EREGO14944 169 aa7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 MPDU1O75352 247 aa7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 S100A5P33763 92 aa7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 SLAQ13239 276 aa7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 FRZBQ92765 325 aa7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 PFDN5Q99471 154 aa7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.53□□□□□ -1.2
KIAA0556-208ENST00000568622 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 IL15RAQ13261 267 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 RAB31Q13636 194 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 ICAM4Q14773 271 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 Q6ZQT7 251 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.52□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 CST7O76096 145 aa7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF492Q9P255 531 aa7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 K7EQD1 137 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 CCSO14618 274 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 PRAF2O60831 178 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV3-53P01767 116 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 GPX1P07203 203 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 PYYP10082 97 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 GCSHP23434 173 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 C8orf49Q96NF6 230 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.5□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 IGSF23A1L1A6 192 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 L7N2F9 121 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 IFNA5P01569 189 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 S100A11P31949 105 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 SULT1A1P50225 295 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 CAV2P51636 162 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 VAMP2P63027 116 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 TRIQKQ629K1 86 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 RASL10AQ92737 203 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.49□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 RGS13O14921 159 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 PLA2G10O15496 165 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 IL7P13232 177 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF415Q09FC8 603 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF479Q96JC4 524 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 MDFICQ9P1T7 246 aa7.48□□□□□ -1.21
KIAA0556-208ENST00000568622 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms