RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561668.5

PKD1-223, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 3

Gene PKD1, Length 665 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-223	ENST00000561668	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	LINC01587	Q99440	93 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668		Q9H3A6	140 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	CELA1	Q9UNI1	258 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	RBAKDN	A6NC62	111 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	CDKN1B	P46527	198 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	OTOR	Q9NRC9	128 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668		A0A1B0GVG6	124 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	CXorf1	O96002	111 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	NMB	P08949	121 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	GCHFR	P30047	84 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	HTN1	P15515	57 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	CRISP2	P16562	243 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	PGP	A6NDG6	321 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	KLLN	B2CW77	178 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	DIRC3	C9JPN6	131 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	LEP	P41159	167 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	TAS2R60	P59551	318 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	CD300C	Q08708	224 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF492	Q9P255	531 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	APLN	Q9ULZ1	77 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668		A0A1W2PRE2	83 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	PFDN1	O60925	122 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	CSN1S1	P47710	185 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	DAD1	P61803	113 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	ERCC8	Q13216	396 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	VGLL1	Q99990	258 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668		H7BYZ3	331 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-223	ENST00000561668	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	PRM2	P04554	102 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF138	P52744	262 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	RYR2	Q92736	4967 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668		J3KRW8	73 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	HTN3	P15516	51 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	FHIT	P49789	147 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	SLC51B	Q86UW2	128 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	C16orf74	Q96GX8	76 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	AZU1	P20160	251 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	FAM210B	Q96KR6	192 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	LYST	Q99698	3801 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	DEFB130B	P0DP73	79 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	DEFB130A	P0DP74	79 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-223	ENST00000561668	RAB5C	P51148	216 aa		13.3	□□□□□ -0.28

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