RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.07□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF586Q9NXT0 402 aa12.07□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRELID1Q9Y255 219 aa12.07□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLAC8L1A1L4L8 177 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 CBY3A6NI87 242 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC17A3O00476 420 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF266Q14584 549 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 MIR17HGQ75NE6 70 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 BLNKQ8WV28 456 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC01587Q99440 93 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR51M1Q9H341 326 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q9H8V8 135 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 FUT9Q9Y231 359 aa12.06□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDKN1BP46527 198 aa12.05□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAS2R45P59539 299 aa12.05□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 PAXXQ9BUH6 204 aa12.05□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC25A2Q9BXI2 301 aa12.05□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR7C2O60412 319 aa12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBEAP1P0C6P0 100 aa12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 PYYP10082 97 aa12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 HTN1P15515 57 aa12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTC32Q5I0X7 151 aa12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 AQP10Q96PS8 301 aa12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 APOBP04114 4563 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A1W2PPV4 95 aa12.03□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAS2R60P59551 318 aa12.03□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 KHDC3LQ587J8 217 aa12.03□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 C16orf74Q96GX8 76 aa12.03□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 LEPP41159 167 aa12.02□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP10-2P60368 255 aa12.02□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa12.02□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRAC2D3DTV9 90 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR10J4P0C629 311 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 M6PRP20645 277 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR5I1Q13606 314 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 WFDC1Q9HC57 220 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNAH5Q8TE73 4624 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 NPIPB6E9PJ23 425 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 NDUFB4O95168 129 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 CSN1S1P47710 185 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 ICAM4Q14773 271 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 LYPD1Q8N2G4 141 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00477Q96M19 166 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 ODF3Q96PU9 254 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q9H3A6 140 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 H7BYZ3 331 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 M0R3E3 92 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 MBP02144 154 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 FXYD5Q96DB9 178 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q5BKY6 102 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 UPK3BQ9BT76 320 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0J9YY99 117 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A1W2PPQ1 181 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 EPM2AB3EWF7 344 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 CT45A10P0DMU9 189 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 RANP62826 216 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 SERF2P84101 59 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF503Q96F45 646 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERCC8Q13216 396 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 ESRGQ1W209 222 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 J3KRW8 73 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATP6V0CP27449 155 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAB2AP61019 212 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms