RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE5Q13069 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE13Q4V321 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-209ENST00000550857 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 PTPN13Q12923 2485 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 DPM2O94777 84 aa6.31□□□□□ -1.4
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