RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CCL3L1P16619 93 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 GPR183P32249 361 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 BMI1P35226 326 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 LYZP61626 148 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 GNG5P63218 68 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CCL8P80075 99 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 RHOGP84095 191 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 FAM201AQ5SY85 155 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 LINC01545Q5VT33 79 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 LCN12Q6JVE5 192 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 Q6ZS92 163 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 TCF24Q7RTU0 167 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 ATOH7Q8N100 152 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 RPEQ96AT9 228 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 LINC00479Q96M42 142 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 THYN1Q9P016 225 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 DYSFO75923 2080 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 TMEM189A5PLL7 270 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SHISA9B4DS77 424 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CCL25O15444 150 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SAP30O75446 220 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CNIH1O95406 144 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PPBPP02775 128 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 COX8AP10176 69 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CEACAM3P40198 252 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 RAB9AP51151 201 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 ARF6P62330 175 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PSG3Q16557 428 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 HCP5Q6MZN7 132 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PRNTQ86SH4 94 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 ORMDL3Q8N138 153 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 DEFB123Q8N688 67 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CCL17Q92583 94 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PSG8Q9UQ74 426 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 DSCAMO60469 2012 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 USP34Q70CQ2 3546 aa3.37□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 A0A087WZ39 114 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 A0A1B0GUV1 79 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 H3BRM9 83 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 H3BRN7 92 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 GNG7O60262 68 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 HBDP02042 147 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CRYGBP07316 175 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 IGLC1P0CG04 106 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 DLX6P56179 175 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 HSD52Q0P140 79 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 MPV17L2Q567V2 206 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SPRNQ5BIV9 151 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 Q71RC1 249 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 GTSF1Q8WW33 167 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PRELID3AQ96N28 172 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 VPS25Q9BRG1 176 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 SMPXQ9UHP9 88 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 VCANP13611 3396 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 EYSQ5T1H1 3165 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 TNCP24821 2201 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 CFAP54Q96N23 3096 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 C7orf71A4D174 169 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 OOSP1A8MZH6 123 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 E7EUB6 86 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-210ENST00000549362 I3L2K1 104 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms