RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	S100A7A	Q86SG5	101 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193		Q86TA4	180 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	C17orf77	Q96MU5	243 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193		A6NDX4	124 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	VAMP3	Q15836	100 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	TPPP3	Q9BW30	176 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	CST9L	Q9H4G1	147 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR183	P32249	361 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF492	Q9P255	531 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	RNF223	E7ERA6	249 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	TGFA	P01135	160 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	CLEC3B	P05452	202 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	CT83	Q5H943	113 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	SVIP	Q8NHG7	77 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM12	Q96EX1	92 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	OTOR	Q9NRC9	128 aa		12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV2-11	P01706	119 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	PTPN13	Q12923	2485 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	ST20	Q9HBF5	79 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF785	A8K8V0	405 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	SNAI2	O43623	268 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	CIDEA	O60543	219 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC140	Q96MF4	163 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GRSF1-208	ENST00000545193	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	MUC21	Q5SSG8	566 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	12.14	□□□□□ -0.47	8e-7	■■■■□ 25.7
GRSF1-208	ENST00000545193		J3QLI3	93 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	FOXE3	Q13461	319 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A087X0K7	114 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	IGF1	P05019	195 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	RABAC1	Q9UI14	185 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHG2	P01859	326 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	BLCAP	P62952	87 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193		Q5PR19	223 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.13	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	TAX1BP3	O14907	124 aa		12.12	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	TCTA	P57738	103 aa		12.12	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP5G2	Q06055	141 aa		12.12	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	HAX1	O00165	279 aa		12.12	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		12.12	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GUT8	65 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193		M0R3E3	92 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	NCR2	O95944	276 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	OR5AL1	P0C617	328 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZS46	218 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	CHD6	Q8TD26	2715 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	TRGV3	P03979	118 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	PDE6H	Q13956	83 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	FXYD7	P58549	80 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM231B	A6NCW3	169 aa		12.09	□□□□□ -0.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms