RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	SEC11B	P0C7V7	166 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	ID1	P41134	155 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PSG9	Q00887	426 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PEA15	Q15121	130 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PSG3	Q16557	428 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	C12orf74	Q32Q52	190 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097		Q6ZQT7	251 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RPRM	Q9NS64	109 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PKD1	P98161	4303 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	NACA	E9PAV3	2078 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	AZU1	P20160	251 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	MEOX2	P50222	304 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	BIN3	Q9NQY0	253 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	COLCA2	A8K830	154 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	MIF	P14174	115 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PPT1	P50897	306 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	EMP1	P54849	157 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	HBG1	P69891	147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	HBG2	P69892	147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	ERCC8	Q13216	396 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	GUK1	Q16774	197 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	ATP6V1F	Q16864	119 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	GPR82	Q96P67	336 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	ATP5S	Q99766	215 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	OR10J4	P0C629	311 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	CT45A10	P0DMU9	189 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RAB5C	P51148	216 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PRR9	Q5T870	116 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	FXYD5	Q96DB9	178 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PKHD1	P08F94	4074 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097		J3KRW8	73 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	FHIT	P49789	147 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	AKR1D1	P51857	326 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RAB2A	P61019	212 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	LCN15	Q6UWW0	184 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	SSX7	Q7RTT5	188 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	BLNK	Q8WV28	456 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	NUPR2	A6NF83	97 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	AKR1C3	P42330	323 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	ZFP82	Q8N141	532 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	PFDN5	Q99471	154 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	NEU1	Q99519	415 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	APLN	Q9ULZ1	77 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CCR3-208	ENST00000545097	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097		M0R036	132 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	MPDU1	O75352	247 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	LY6G6C	O95867	125 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	RAB5B	P61020	215 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	RHOB	P62745	196 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	RAB31	Q13636	194 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	VGLL1	Q99990	258 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	DKK2	Q9UBU2	259 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	FUT9	Q9Y231	359 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CCR3-208	ENST00000545097	UMAD1	C9J7I0	102 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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