RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZTI0 123 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 SSX7Q7RTT5 188 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 STX12Q86Y82 276 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF503Q96F45 646 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 ATG101Q9BSB4 218 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 CRISP2P16562 243 aa8.17□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 BTN1A1Q13410 526 aa8.17□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 THAP6Q8TBB0 222 aa8.17□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 C18orf15Q96N68 181 aa8.17□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 Q9H8V8 135 aa8.17□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0J9YY99 117 aa8.16□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 C7orf71A4D174 169 aa8.16□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 H3BNG1 76 aa8.16□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 M6PRP20645 277 aa8.16□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 H2BFSP57053 126 aa8.16□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.16□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 BLNKQ8WV28 456 aa8.16□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 S100ZQ8WXG8 99 aa8.16□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 FXYD5Q96DB9 178 aa8.16□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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CLSTN3-211ENST00000541667 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.13□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 Q9H3A6 140 aa8.13□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 FUT9Q9Y231 359 aa8.13□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 PRAF2O60831 178 aa8.12□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 GPX1P07203 203 aa8.12□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 OR10J4P0C629 311 aa8.12□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.12□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 ENKURQ8TC29 256 aa8.12□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.12□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.12□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 PAXXQ9BUH6 204 aa8.12□□□□□ -1.11
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CLSTN3-211ENST00000541667 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.11□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.11□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 MPC2O95563 127 aa8.11□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF138P52744 262 aa8.11□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PPQ1 181 aa8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 RANP62826 216 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 FHL2Q14192 279 aa8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8TAT8 98 aa8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.1□□□□□ -1.11
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