RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534946.5

LMO3-211, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 1,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-211ENST00000534946 M0R3E3 92 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 CDKN1BP46527 198 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 RANP62826 216 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 OR11H2Q8NH07 326 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 TMED6Q8WW62 240 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 LINC00477Q96M19 166 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 NEU1Q99519 415 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-211ENST00000534946 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 A0A1W2PRE2 83 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TEX46H3BTG2 121 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 K7EQM0 130 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 NMBP08949 121 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 PPT1P50897 306 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 X6R8D5 127 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TMEM189A5PLL7 270 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 PRAC2D3DTV9 90 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 ZNF726P1Q15940 193 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 AGRNO00468 2067 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 PGPA6NDG6 321 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 M0R2Z0 102 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 HBE1P02100 147 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 ZNF138P52744 262 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 CD300CQ08708 224 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 SSX7Q7RTT5 188 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 DIRC3C9JPN6 131 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 SULT1A2P50226 295 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 FXYD7P58549 80 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 Q8NAQ8 132 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 A0A0J9YWU9 116 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 GGTLC3B5MD39 225 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 C3orf84H3BNL1 204 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 H7BYZ3 331 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 CT45A10P0DMU9 189 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 CRISP2P16562 243 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 FHITP49789 147 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 RRN3P1Q2M238 152 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 MUC7Q8TAX7 377 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 ATG101Q9BSB4 218 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 ZNF492Q9P255 531 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 KLLNB2CW77 178 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 F6UZH7 168 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 IFNA7P01567 189 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TCRAP04437 139 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TAS2R60P59551 318 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 ERCC8Q13216 396 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 MANBALQ9NQG1 85 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-211ENST00000534946 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-211ENST00000534946 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-211ENST00000534946 C7orf71A4D174 169 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-211ENST00000534946 FAM74A7A6NL05 159 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-211ENST00000534946 IFNA1P01562 189 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-211ENST00000534946 GPX1P07203 203 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-211ENST00000534946 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-211ENST00000534946 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-211ENST00000534946 VGLL1Q99990 258 aa8.46□□□□□ -1.06
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