RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530170.1

RPS3-215, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 531 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-215ENST00000530170 PRNTQ86SH4 94 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 U3KQK5 164 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 FAM223BA6NKX1 122 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 M0R2Z0 102 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 NPFFO15130 113 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 LY6G6DO95868 133 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 IGLC3P0DOY3 106 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 BMI1P35226 326 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 SAA4P35542 130 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 CAMPP49913 170 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 FBLN7Q53RD9 439 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 U3KQE9 123 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PAX8Q06710 450 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 SPATA45Q537H7 98 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PET117Q6UWS5 81 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 DPF1Q92782 380 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PRR25Q96S07 402 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 ST20Q9HBF5 79 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 AKAP6Q13023 2319 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.271e-9■■■■□ 25.6
RPS3-215ENST00000530170 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 A0A1B0GV90 55 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 H3BTX0 84 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 ATP6V0E1O15342 81 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 BUB3O43684 328 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 IGLC6P0CF74 106 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 CD33P20138 364 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 CRIP1P50238 77 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 TMEM189A5PLL7 270 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 LINC01546A6NGU7 62 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 M0R3E3 92 aa7.09□□□□□ -1.27
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RPS3-215ENST00000530170 LINC00614P0C842 121 aa7.09□□□□□ -1.27
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RPS3-215ENST00000530170 RHOGP84095 191 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 GAGE1Q13065 139 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 C15orf32Q32M92 178 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 CCDC140Q96MF4 163 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 C17orf77Q96MU5 243 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 OR2T8A6NH00 312 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 INAFM1C9JVW0 142 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 LEPROTL1O95214 131 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 IGHV1-69P01742 117 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 IGHV4-39P01824 125 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 IGHG4P01861 327 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 IGF1P05019 195 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 PSMG4Q5JS54 123 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 DEFB125Q8N687 156 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 SGK494Q96LW2 274 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 METTL26Q96S19 204 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 ASCL2Q99929 193 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 HIVEP2P31629 2446 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 CD24P25063 80 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 GPR183P32249 361 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-215ENST00000530170 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
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