RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 HSPB11Q9Y547 144 aa4.84□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 PGPA6NDG6 321 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 C9orf118A6NHY6 69 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 K7EQG2 157 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 ISLRO14498 428 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GPX1P07203 203 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 MUC21Q5SSG8 566 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 STOML3Q8TAV4 291 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 VSIRQ9H7M9 311 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 IGLL5B9A064 214 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 HBE1P02100 147 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 S100A6P06703 90 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP6V0CP27449 155 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TENM2Q9NT68 2774 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf88P0DMB2 117 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 ERCC8Q13216 396 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 OR5I1Q13606 314 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 OXA1LQ15070 435 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 AKAP14Q86UN6 197 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GGACTQ9BVM4 153 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 Q9H8V8 135 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 MPDU1O75352 247 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 LY6G6CO95867 125 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 PATE2Q6UY27 113 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 Q8TAT8 98 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TMED6Q8WW62 240 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 H3BQ15 152 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFB4O95168 129 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 PSG9Q00887 426 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 PSG3Q16557 428 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFP69Q49AA0 526 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 MUC7Q8TAX7 377 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 MUC4Q99102 2169 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC17A3O00476 420 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 M6PRP20645 277 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 C4BPBP20851 252 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 PPT1P50897 306 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 H3BRN7 92 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR82Q96P67 336 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 WFDC1Q9HC57 220 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 H3BMM0 161 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV3-53P01767 116 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 DCANP1Q8TF63 244 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 FUT9Q9Y231 359 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 PRAC2D3DTV9 90 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 F5H768 121 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 M0R036 132 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TSPOP30536 169 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GNG5P63218 68 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 C20orf173Q96LM9 149 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1B0GVG6 124 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 SNURFLB1AK76 121 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 JTBO76095 146 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 INSP01308 110 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMB3P49720 205 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 FHITP49789 147 aa4.8□□□□□ -1.64
RRN3P1-201ENST00000514813 DAD1P61803 113 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms