RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514515.5

NREP-222, Transcript of neuronal regeneration related protein, human

TSL 1 (best)

Gene NREP, Length 3,564 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NREP-222	ENST00000514515	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	WFDC2	Q14508	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	KALRN	O60229	2985 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		J3KRW8	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ERCC8	Q13216	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		A0A1B0GWB2	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ODF1	Q14990	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	NBR2	O15453	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CRYGB	P07316	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	DLX6	P56179	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		Q9UFV3	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ATM	Q13315	3056 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	OVOL3	O00110	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	PDE6H	Q13956	83 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CEND1	Q8N111	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		U3KQK5	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ATP5L	O75964	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	LY6H	O94772	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	EFNA4	P52798	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	KLRD1	Q13241	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	IGLL5	B9A064	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		E7EQL1	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CEACAM4	O75871	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ARL3	P36405	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		A0A1B0GV72	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	THBD	P07204	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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