RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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VWA3B-220ENST00000495571 MED13Q9UHV7 2174 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CADP27708 2225 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.71□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 UPK2O00526 184 aa6.71□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 IL4P05112 153 aa6.71□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 C2orf83Q53S99 150 aa6.71□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.71□□□□□ -1.33
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VWA3B-220ENST00000495571 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.71□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 HCP5Q6MZN7 132 aa6.7□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.7□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.7□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 PIFOQ8TCI5 191 aa6.7□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01587Q99440 93 aa6.7□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.7□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 UBE2D2P62837 147 aa6.7□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 TWIST1Q15672 202 aa6.7□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.7□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 RNF185Q96GF1 192 aa6.7□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.69□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.69□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.69□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 C9JAW5 83 aa6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.68□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZS46 218 aa6.67□□□□□ -1.34
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VWA3B-220ENST00000495571 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 H7C2G1 150 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 CEACAM4O75871 244 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 TNFRSF6BO95407 300 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 CD7P09564 240 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 UBE2D1P51668 147 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 Q8N1Y9 231 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 NRGNQ92686 78 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 TAL2Q16559 108 aa6.66□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.66□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZS92 163 aa6.66□□□□□ -1.34
VWA3B-220ENST00000495571 Q8TAT8 98 aa6.66□□□□□ -1.34
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