RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 C15orf61A6NNL5 157 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF223E7ERA6 249 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 UPK2O00526 184 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SYNGR2O43760 224 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-69P01742 117 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1-16P04430 117 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP5G3P48201 142 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 INSL3P51460 131 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC32Q5I0X7 151 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GWB2 263 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE2BQ13066 116 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 EBI3Q14213 229 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE2EQ4V326 116 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GX51 115 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 F5H768 121 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 J3KT08 172 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EN84 100 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMM23O14925 209 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLV2-23P01705 113 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SAA4P35542 130 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PSG5Q15238 335 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf52Q96A22 123 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PSENENQ9NZ42 101 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 MDFICQ9P1T7 246 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FBN2P35556 2912 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYGBP07316 175 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 OPRK1P41145 380 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL16Q0P5N6 197 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXE3Q13461 319 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 NPBQ8NG41 125 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 AJUBAQ96IF1 538 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ENY2Q9NPA8 101 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.51e-10■■■■□ 23.8
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BP45 60 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFA3O95167 84 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM106CPP0CH98 169 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 HIGD1BQ9P298 99 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLL5B9A064 214 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FSHBP01225 129 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 AREGP15514 252 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PRCDQ00LT1 54 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FHL3Q13643 280 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMG4Q5JS54 123 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8N6K4 173 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 STPG3Q8N7X2 389 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TCF19Q9Y242 345 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RRHO14718 337 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 NBR2O15453 112 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 NXPH3O95157 252 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 CSN3P07498 182 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SPG11Q96JI7 2443 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPN13Q12923 2485 aa5.68□□□□□ -1.5
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