RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 ICAM4Q14773 271 aa6.16□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.16□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.16□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.16□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 GGACTQ9BVM4 153 aa6.16□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 MUC4Q99102 2169 aa6.16□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 CXCL2P19875 107 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP10-2P60368 255 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZRG5 221 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 C6orf223Q8N319 242 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF503Q96F45 646 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC3-211ENST00000491581 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.15□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 C7orf71A4D174 169 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 C16orf90A8MZG2 172 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 RLN2P04090 185 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 H2BFSP57053 126 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 MUC21Q5SSG8 566 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 FXYD5Q96DB9 178 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 Q9H8V8 135 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 SNURFLB1AK76 121 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 KLLNB2CW77 178 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 M6PRP20645 277 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 S100A7P31151 101 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 S100A11P31949 105 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 LEPP41159 167 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 CCL18P55774 89 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 Q8N3U1 123 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC32Q9BV29 185 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 SFTA3P0C7M3 94 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 ASAH1Q13510 395 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 RAB31Q13636 194 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 STX12Q86Y82 276 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 PFDN5Q99471 154 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 WFDC1Q9HC57 220 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 MDFICQ9P1T7 246 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 FUT9Q9Y231 359 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 UPK1BO75841 260 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 GPX1P07203 203 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 RANP62826 216 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 GUK1Q16774 197 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 ENKURQ8TC29 256 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 SGK494Q96LW2 274 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 ODF3Q96PU9 254 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 OR51M1Q9H341 326 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 SPINK4O60575 86 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 PRAF2O60831 178 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF253O75346 499 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00315P59091 139 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 GNG5P63218 68 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 HBG1P69891 147 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 HBG2P69892 147 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 S100A7AQ86SG5 101 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 HYLS1Q96M11 299 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00477Q96M19 166 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 C8orf49Q96NF6 230 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC3-211ENST00000491581 PAXXQ9BUH6 204 aa6.1□□□□□ -1.43
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