RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PRO0628Q9UI54 55 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ERGIC3Q9Y282 383 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0A6YYH2 397 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 A6NJ64 397 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM212A6NML5 194 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 H7C2Y5 167 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC22A1O15245 554 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ARL6IP5O75915 188 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2A4O95047 310 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1-16P04430 117 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5AL1P0C617 328 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf88P0DMB2 117 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DMBP28068 263 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HSD11B1P28845 292 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TPPP2P59282 170 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TPBGQ13641 420 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 MMDQ15546 238 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LELP1Q5T871 98 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM244Q5VVB8 128 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM144Q7Z5S9 345 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GAPTQ8N292 157 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5H2Q8NGV7 314 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 THEM6Q8WUY1 208 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CYGBQ8WWM9 190 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM19Q96E16 107 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM8Q96KF7 97 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2A7Q96R45 310 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL26Q96S19 204 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CHST5Q9GZS9 411 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR51V1Q9H2C8 321 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ACOT13Q9NPJ3 140 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFB11Q9NX14 153 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ENPP5Q9UJA9 477 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR52A1Q9UKL2 312 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MEIKINA0A087WXM9 373 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 A8MWP6 167 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TOR1AO14656 332 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 RPP14O95059 124 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 CNIH1O95406 144 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TRGV3P03979 118 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 PRM2P04554 102 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 CD2P06729 351 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 HTR1AP08908 422 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 UBBP0CG47 229 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 LIMS3P0CW19 117 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 LIMS4P0CW20 117 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ATF1P18846 271 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ETV6P41212 452 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPINB10P48595 397 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS2R60P59551 318 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB1P60022 68 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR176Q14439 515 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 SSX1Q16384 188 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TAL2Q16559 108 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 Q499Y3 187 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MORN2Q502X0 79 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 AKIRIN2Q53H80 203 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 PYDC2Q56P42 97 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 PDZD11Q5EBL8 140 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 HACD4Q5VWC8 232 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 XAF1Q6GPH4 301 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM231DQ6ZW35 169 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00596Q86U02 117 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8IYB0 196 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 STX19Q8N4C7 294 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 OR13C9Q8NGT0 318 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNRF2Q8NHG8 242 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ACOT12Q8WYK0 555 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 PP6455Q8WZ26 134 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 AP3S1Q92572 193 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ABHD14BQ96IU4 210 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 CNBD2Q96M20 576 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TBX5Q99593 518 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MGLLQ99685 303 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 BABAM2Q9NXR7 383 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TVP23BQ9NYZ1 205 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-211ENST00000489450 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms