RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 PRNTQ86SH4 94 aa8.59□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 PRR25Q96S07 402 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 TUBA4BQ9H853 241 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 BIN3Q9NQY0 253 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 OSTCQ9NRP0 149 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 OR4C46A6NHA9 309 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 PPP1R2P9O14990 202 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.58□□□□□ -1.04
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C9orf3-220ENST00000489318 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 A8MTW9 85 aa8.57□□□□□ -1.04
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C9orf3-220ENST00000489318 ZNF688P0C7X2 276 aa8.57□□□□□ -1.04
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C9orf3-220ENST00000489318 ZNF138P52744 262 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 OR5I1Q13606 314 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 PSMG4Q5JS54 123 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.57□□□□□ -1.04
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C9orf3-220ENST00000489318 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.57□□□□□ -1.04
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C9orf3-220ENST00000489318 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 V9GYV3 84 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 A0A0J9YX75 114 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 H7BYZ3 331 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 INSL3P51460 131 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ERCC8Q13216 396 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 CT83Q5H943 113 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 C8orf49Q96NF6 230 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 IMMP2LQ96T52 175 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ATRQ13535 2644 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 F6UB75 175 aa8.55□□□□□ -1.04
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C9orf3-220ENST00000489318 CRISP2P16562 243 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 DEFB1P60022 68 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ERVFC1-1P60608 527 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 BTN1A1Q13410 526 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 CT45A10P0DMU9 189 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 CRIP1P50238 77 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 SMUG1Q53HV7 270 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 PRR27Q6MZM9 219 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 NUDT11Q96G61 164 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ASCL2Q99929 193 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 KLLNB2CW77 178 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 HLA-DRB4P13762 266 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 DEFB131AP59861 70 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 ELOBQ15370 118 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 IL36BQ9NZH7 164 aa8.53□□□□□ -1.04
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