RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	SIVA1	O15304	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	AZU1	P20160	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	FGF7	P21781	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	GCSH	P23434	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	LEP	P41159	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	IL15RA	Q13261	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	PDE6H	Q13956	83 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-223	ENST00000489100	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		H3BQ15	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		H3BTX0	84 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PSCA	O43653	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PRAF2	O60831	178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE7	O76087	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PRM2	P04554	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	ESRG	Q1W209	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		E5RGE8	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	UPK1B	O75841	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	XG	P55808	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	NMES1	Q9C002	83 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		H3BNG1	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		M0R3E3	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	NXPH4	O95158	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PET100	P0DJ07	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	HAMP	P81172	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A087WTM6	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	C7orf71	A4D174	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	KLLN	B2CW77	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100		J3KRW8	73 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	NDUFB4	O95168	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	NMB	P08949	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	PYY	P10082	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	EVI2A	P22794	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	DEFA1	P59665	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	DEFA3	P59666	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	NHLH2	Q02577	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms