RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 B2MP61769 119 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPCS2Q15005 226 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 C2orf83Q53S99 150 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 C18orf15Q96N68 181 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 LINC01587Q99440 93 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUDT15Q9NV35 164 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSPG2P98160 4391 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 PKD1P98161 4303 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A087WXM4 84 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A0G2JRQ6 117 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A0J9YY99 117 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 GABARAPH6UMI1 98 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 GABARAPO95166 117 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 IFNA5P01569 189 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 P0C879 139 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 AZU1P20160 251 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 LEPP41159 167 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR2F1Q13607 317 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 BSXQ3C1V8 233 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 BAP18Q8IXM2 172 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 Q8NBF4 154 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPX8Q8TED1 209 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR146Q96CH1 333 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 RSG1Q9BU20 258 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 Q9H3A6 140 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 MDFICQ9P1T7 246 aa4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMCO3A2RU48 225 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TEX46H3BTG2 121 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SOCS3O14543 225 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 FABP1P07148 127 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 CT45A10P0DMU9 189 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 GALR1P47211 349 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 MEOX2P50222 304 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 RHOBP62745 196 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF90Q03938 601 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 RGS21Q2M5E4 152 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZFP69Q49AA0 526 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4.86□□□□□ -1.63
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APOBEC3G-206ENST00000486357 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR52E5Q8NH55 327 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC35E1Q96K37 410 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC25A22Q9H936 323 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 COMMD3Q9UBI1 195 aa4.86□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADAP1O75689 374 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR5AC1P0C628 307 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELK1P19419 428 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 M6PRP20645 277 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSPOP30536 169 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 LINC00315P59091 139 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 LSM3P62310 102 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 NEDD8Q15843 81 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ESRGQ1W209 222 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 AMTNQ6UX39 209 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARRDC1Q8N5I2 433 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF738Q8NE65 137 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 MARCH1Q8TCQ1 289 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM25AB3EWG3 89 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM25CB3EWG5 89 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM25GB3EWG6 89 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSPAN13O95857 204 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD3DP04234 171 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TGFBR1P36897 503 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMBIM6P55061 237 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAS2R60P59551 318 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF846Q147U1 533 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 LGI3Q8N145 548 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.84□□□□□ -1.63
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF182Q8N6D2 247 aa4.84□□□□□ -1.63
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