RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 C3orf79P0CE67 100 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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CDHR3-211ENST00000478080 FAM231BA6NCW3 169 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 A6NDX4 124 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 HSBP1O75506 76 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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CDHR3-211ENST00000478080 TMEM189A5PLL7 270 aa6.82□□□□□ -1.32
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CDHR3-211ENST00000478080 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF575Q86XF7 245 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 METTL26Q96S19 204 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 VAMP8Q9BV40 100 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 LRRK2Q5S007 2527 aa6.82□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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CDHR3-211ENST00000478080 M0R2Z0 102 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 CSN3P07498 182 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 NPSP0C0P6 89 aa6.81□□□□□ -1.32
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CDHR3-211ENST00000478080 ARL3P36405 182 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 KRTAP10-9P60411 292 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF843Q8N446 348 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 PF4V1P10720 104 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 Q6ZQT7 251 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.81□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 IGHG2P01859 326 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 IGF1P05019 195 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 GAGE1Q13065 139 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 BORCS7Q96B45 105 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 A0A087X0K7 114 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 FAM223BA6NKX1 122 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB1P60022 68 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 RIGQ13278 110 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV4-59P01825 116 aa6.8□□□□□ -1.32
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CDHR3-211ENST00000478080 U3KQE9 123 aa6.8□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 A0A096LNT2 108 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 TGFAP01135 160 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 COX6B1P14854 86 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 EDN2P20800 178 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 RAB9AP51151 201 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 AMN1Q8IY45 258 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 C20orf173Q96LM9 149 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 C2orf70A6NJV1 201 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 RNF223E7ERA6 249 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00614P0C842 121 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 S100A7P31151 101 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.79□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.79□□□□□ -1.32
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CDHR3-211ENST00000478080 FOXE3Q13461 319 aa6.78□□□□□ -1.32
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CDHR3-211ENST00000478080 C16orf92Q96LL3 132 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 J3KRW8 73 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 CTRLP40313 264 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 TWIST1Q15672 202 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 ERASQ7Z444 233 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 GPHB5Q86YW7 130 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.78□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.77□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.77□□□□□ -1.33
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