RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	PRR25	Q96S07	402 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	HLA-DMB	P28068	263 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF138	P52744	262 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	PROK1	P58294	105 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	FHL3	Q13643	280 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	VGLL1	Q99990	258 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.08	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.08	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	SLURP1	P55000	103 aa		13.08	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		13.08	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.08	□□□□□ -0.31
TAPBP-238	ENST00000475304	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	CD28	P10747	220 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304		Q6AWC8	147 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	ASCL2	Q99929	193 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	CCL24	O00175	119 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	MT-ND6	P03923	174 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304		K7EQG2	157 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	HAX1	O00165	279 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	C8orf49	Q96NF6	230 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	TRGC2	P03986	189 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	S100A6	P06703	90 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304		Q8TAT8	98 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	NEU1	Q99519	415 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	EDN2	P20800	178 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	CRIP1	P50238	77 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	ERCC8	Q13216	396 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	SH2D1A	O60880	128 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	CSN3	P07498	182 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	TCL1A	P56279	114 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	ZFP82	Q8N141	532 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304		A0A1B0GW15	77 aa		13	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	PHOX2A	O14813	284 aa		13	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	S100A8	P05109	93 aa		13	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13	□□□□□ -0.33
TAPBP-238	ENST00000475304	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13	□□□□□ -0.33

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