RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	GNG7	O60262	68 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	CTSG	P08311	255 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	S100G	P29377	79 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	CCL18	P55774	89 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	OR2F1	Q13607	317 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF773	Q6PK81	442 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	CYGB	Q8WWM9	190 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RASL10A	Q92737	203 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	MRAP2	Q96G30	205 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SEC22A	Q96IW7	307 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	OR10C1	Q96KK4	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	METTL26	Q96S19	204 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	PFDN5	Q99471	154 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RFNG	Q9Y644	331 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936		F8W036	122 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936		K7EIM0	57 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936		K7EQG2	157 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	UPK2	O00526	184 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	MFNG	O00587	321 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SNAPC5	O75971	98 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	HLA-DQB1	P01920	261 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RAB5A	P20339	215 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	NPPC	P23582	126 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RAB2A	P61019	212 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	WT1-AS	Q06250	92 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	CATR1	Q13166	79 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	DHRS2	Q13268	280 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM12	Q96EX1	92 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	BTF3L4	Q96K17	158 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	VSIR	Q9H7M9	311 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RAB22A	Q9UL26	194 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	TAAR5	O14804	337 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	HPRT1	P00492	218 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	IFNA1	P01562	189 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	OR5AL1	P0C617	328 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	GALR1	P47211	349 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	CD300C	Q08708	224 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	MSMO1	Q15800	293 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	COMMD7	Q86VX2	200 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	OR1P1	Q8NH06	330 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	OR51H1	Q8NH63	302 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936		Q8WTZ3	238 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	SIGMAR1	Q99720	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	DUSP21	Q9H596	190 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	BIN3	Q9NQY0	253 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CEP170-209	ENST00000464936	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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