RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BCAP31P51572 246 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL15RAQ13261 267 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SSX7Q7RTT5 188 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C2orf50Q96LR7 162 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PFDN5Q99471 154 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.54□□□□□ -1.36
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGSF23A1L1A6 192 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C5orf51A6NDU8 294 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H3BNG1 76 aa6.53□□□□□ -1.36
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 S100A11P31949 105 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LEPP41159 167 aa6.53□□□□□ -1.36
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 CLINT1Q14677 625 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.53□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.53□□□□□ -1.36
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLLNB2CW77 178 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 M0R3E3 92 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GAGE7O76087 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDUFB4O95168 129 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GAGE12FP0CL80 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GAGE12GP0CL81 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GAGE12IP0CL82 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 S100A10P60903 97 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HBG1P69891 147 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HBG2P69892 147 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BAXQ07812 192 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR5I1Q13606 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB32Q13637 225 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PDE6HQ13956 83 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STX12Q86Y82 276 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C18orf15Q96N68 181 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UPK3BQ9BT76 320 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC32Q9BV29 185 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDIP1Q9H305 208 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q9H3A6 140 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q9H8V8 135 aa6.52□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C16orf90A8MZG2 172 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 J3KRW8 73 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MPDU1O75352 247 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDK2AP2O75956 126 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FGF7P21781 194 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP6V1FQ16864 119 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TTC32Q5I0X7 151 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q6ZTI0 123 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRELID1Q9Y255 219 aa6.51□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A0J9YY99 117 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C7orf71A4D174 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PYYP10082 97 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRISP2P16562 243 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ERCC8Q13216 396 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ESRGQ1W209 222 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00477Q96M19 166 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A1W2PPQ1 181 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NMBP08949 121 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CD300CQ08708 224 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BTN1A1Q13410 526 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ASAH1Q13510 395 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.49□□□□□ -1.37
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.49□□□□□ -1.37
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