RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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DDX39B-209ENST00000428450 HSPB11Q9Y547 144 aa7.53□□□□□ -1.2
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DDX39B-209ENST00000428450 IGLV2-11P01706 119 aa7.52□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 RAP2BP61225 183 aa7.5□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 PRR13Q9NZ81 148 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 C7orf71A4D174 169 aa7.49□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 ORM1P02763 201 aa7.49□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 S100A12P80511 92 aa7.49□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 PATE2Q6UY27 113 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 ASB13Q8WXK3 278 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF479Q96JC4 524 aa7.49□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 TM2D2Q9BX73 214 aa7.49□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 IGHV3-33P01772 117 aa7.48□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.48□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 TBPP20226 339 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 BTCP35070 178 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 LAGE3Q14657 143 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 ODF1Q14990 250 aa7.48□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.48□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 Q6ZQT7 251 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 OR52I2Q8NH67 350 aa7.47□□□□□ -1.21
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DDX39B-209ENST00000428450 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 GPR132Q9UNW8 380 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-209ENST00000428450 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 HMSDA8MTL9 139 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 FAM25EA8MYX2 175 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 C9JCJ5 164 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 H3BTX0 84 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 HPGDSO60760 199 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 MPC2O95563 127 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 TCRBP04435 133 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00869P0C866 280 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-209ENST00000428450 AKR1C4P17516 323 aa7.46□□□□□ -1.22
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