RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390394.3

TRBV20-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20-1, Length 413 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF124Q15973 351 aa7.13□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.13□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6ZWC4 215 aa7.13□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.13□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 B9D2Q9BPU9 175 aa7.13□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZMAT4Q9H898 229 aa7.13□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 PEX7O00628 323 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV3-20P01619 116 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 FMC1Q96HJ9 113 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPATA25Q9BR10 227 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF492Q9P255 531 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 COL7A1Q02388 2944 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.11□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 TENM3Q9P273 2699 aa7.11□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 INSP01308 110 aa7.11□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.11□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.11□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM250H0YL14 139 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 GPX1P07203 203 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 CT45A10P0DMU9 189 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 ATP5G3P48201 142 aa7.1□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 GNG5P63218 68 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 PEA15Q15121 130 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 CLLU1Q5K131 121 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 RCHY1Q96PM5 261 aa7.1□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 SPRY2O43597 315 aa7.09□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 CRISP2P16562 243 aa7.09□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 TAS2R60P59551 318 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.09□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 C11orf52Q96A22 123 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 XCL2Q9UBD3 114 aa7.09□□□□□ -1.27
TRBV20-1-201ENST00000390394 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRBV20-1-201ENST00000390394 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.08□□□□□ -1.28
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TRBV20-1-201ENST00000390394 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.07□□□□□ -1.28
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TRBV20-1-201ENST00000390394 IFITM2Q01629 132 aa7.07□□□□□ -1.28
TRBV20-1-201ENST00000390394 DEFB135Q30KP9 77 aa7.07□□□□□ -1.28
TRBV20-1-201ENST00000390394 SMUG1Q53HV7 270 aa7.07□□□□□ -1.28
TRBV20-1-201ENST00000390394 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.07□□□□□ -1.28
TRBV20-1-201ENST00000390394 NEU1Q99519 415 aa7.07□□□□□ -1.28
TRBV20-1-201ENST00000390394 ASCL2Q99929 193 aa7.07□□□□□ -1.28
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TRBV20-1-201ENST00000390394 AGRNO00468 2067 aa7.06□□□□□ -1.28
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM189A5PLL7 270 aa7.06□□□□□ -1.28
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