RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 SMIM12Q96EX1 92 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 MLXQ9UH92 298 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 CRLF1O75462 422 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFA7O95182 113 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 TFPI2P48307 235 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 PRR25Q96S07 402 aa11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.59□□□□□ -0.55
CASQ1-201ENST00000368078 TRGC2P03986 189 aa11.58□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.58□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 PROK1P58294 105 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 KRTAP10-3P60369 221 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF738Q8NE65 137 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 DCANP1Q8TF63 244 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF492Q9P255 531 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 F6UB75 175 aa11.57□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 P01737 135 aa11.56□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 RPL19P84098 196 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 SMUG1Q53HV7 270 aa11.56□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.56□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 RBAKDNA6NC62 111 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 GZMBP10144 247 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 AGRNO00468 2067 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 CCL24O00175 119 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 CSN3P07498 182 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 BIN3Q9NQY0 253 aa11.55□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 RAB5BP61020 215 aa11.54□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.54□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 NUP35Q8NFH5 326 aa11.54□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.54□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 PHOX2AO14813 284 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 TYMSP04818 313 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 BMI1P35226 326 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 Q6ZQT7 251 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 TSKUQ8WUA8 353 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 GTSF1Q8WW33 167 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 FRZBQ92765 325 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 NEU1Q99519 415 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 SH2D1AO60880 128 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF138P52744 262 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 FHL3Q13643 280 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 BTF3L4Q96K17 158 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 PEMTQ9UBM1 199 aa11.53□□□□□ -0.56
CASQ1-201ENST00000368078 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIGD1CA8MV81 97 aa11.52□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 K7EQG2 157 aa11.52□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 OVOL1O14753 267 aa11.52□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF688P0C7X2 276 aa11.52□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 CT45A10P0DMU9 189 aa11.52□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.52□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 JMJD1CQ15652 2540 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 M0QZ24 198 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 CD33P20138 364 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 ID1P41134 155 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF575Q86XF7 245 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 A8MWL6 223 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 J3KRW8 73 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TRGC1P0CF51 173 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 PSMG4Q5JS54 123 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.51□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BKO60814 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BJP06899 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BOP23527 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BBP33778 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BDP58876 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BCP62807 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 PRR31Q5SQ13 230 aa11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms