RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.67□□□□□ -1.02
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SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.67□□□□□ -1.02
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SH3BP2-201ENST00000356331 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-201ENST00000356331 C15orf62A8K5M9 175 aa8.61□□□□□ -1.03
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