RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ZNF114Q8NC26 417 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PTPN13Q12923 2485 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 A6NDX4 124 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 H3BUX3 64 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SEC11BP0C7V7 166 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ATP6V0CP27449 155 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ARPC1AQ92747 370 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MT-ATP8P03928 68 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 CX3CL1P78423 397 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 LY6EQ16553 131 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SYT8Q8NBV8 401 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PARP11Q9NR21 331 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 KCNIP2Q9NS61 270 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 A8MZ25 164 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 FNDC10F2Z333 226 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 CD5LO43866 347 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SLC35B1P78383 322 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 NDPQ00604 133 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PVRIGQ6DKI7 326 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 BORCS7Q96B45 105 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 FAM157CP0CG43 387 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MFAP2P55001 183 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PRO0628Q9UI54 55 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ETDBQ3ZM63 59 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 FAM106AQ4KMX7 169 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TREML4Q6UXN2 200 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 GNG13Q9P2W3 67 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 RHODO00212 210 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 CD69Q07108 199 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SNCGO76070 127 aa4.75□□□□□ -1.65
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CCR6-201ENST00000341935 FOXE3Q13461 319 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MLANAQ16655 118 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 Q6YL49 198 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SPATA25Q9BR10 227 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 K7EP34 96 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGHV4-59P01825 116 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 OPRK1P41145 380 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MED13LQ71F56 2210 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ATP6V0E1O15342 81 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 DEFA4P12838 97 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 OR2T6Q8NHC8 308 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MGST2Q99735 147 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GWB2 263 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 LINC01548A6NM66 108 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TEPPQ6URK8 271 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TMEM101Q96IK0 257 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C20orf173Q96LM9 149 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ITPR3Q14573 2671 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TNCP24821 2201 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ORM2P19652 201 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 EVI2AP22794 236 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SERF2P84101 59 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 DEFB125Q8N687 156 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 VSIRQ9H7M9 311 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.74□□□□□ -1.65
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