RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 Q8N9W7 124 aa12.75□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 NDFIP1Q9BT67 221 aa12.75□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.75□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 EBI3Q14213 229 aa12.75□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 HLA-DMBP28068 263 aa12.75□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.75□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 NEGR1Q7Z3B1 354 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 RAB37Q96AX2 223 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 AJUBAQ96IF1 538 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 MINOS1Q5TGZ0 78 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 COL12A1Q99715 3063 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 ITPR1Q14643 2758 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM70Q9BUB7 260 aa12.73□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 PDE6HQ13956 83 aa12.73□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 ECSCRQ19T08 205 aa12.73□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 Q8TAT8 98 aa12.73□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 LINC01548A6NM66 108 aa12.72□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 ST20Q9HBF5 79 aa12.72□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 OOSP1A8MZH6 123 aa12.72□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 LEPROTL1O95214 131 aa12.72□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 CT45A10P0DMU9 189 aa12.72□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 PMCHL2Q9BQD1 86 aa12.72□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa12.72□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 GPR183P32249 361 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 CSN1S1P47710 185 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 HSD52Q0P140 79 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 RIGQ13278 110 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 OR2K2Q8NGT1 345 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 VGLL1Q99990 258 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 SH2D1AO60880 128 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 IGHG4P01861 327 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 FAM106CPP0CH98 169 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 SCGB1A1P11684 91 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 SAA4P35542 130 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 C15orf32Q32M92 178 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.71□□□□□ -0.37
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM213A2RRL7 107 aa12.71□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa12.71□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.71□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 RABAC1Q9UI14 185 aa12.71□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 G3V318 75 aa12.7□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 K7EP34 96 aa12.7□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 ATP6V0E1O15342 81 aa12.7□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 FAM162BQ5T6X4 162 aa12.7□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa12.7□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 C19orf84I3L1E1 186 aa12.7□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 CLEC3BP05452 202 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 OR10AG1Q8NH19 301 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM189A5PLL7 270 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 UBE2E1P51965 193 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 LMO4P61968 165 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 PRR25Q96S07 402 aa12.69□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.68□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 CRXO43186 299 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 EFNA4P52798 201 aa12.68□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 FAM106AQ4KMX7 169 aa12.68□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 TCTAP57738 103 aa12.68□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 SPCS1Q9Y6A9 102 aa12.68□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 C9orf118A6NHY6 69 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF502Q8TBZ5 544 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0G2JLM5 398 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 AMN1Q8IY45 258 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 SCRT2Q9NQ03 307 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 RNF182Q8N6D2 247 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 GATD1Q8NB37 220 aa12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 PRAC2D3DTV9 90 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 ERCC8Q13216 396 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM97Q5BJF2 176 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM190Q8WZ59 177 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 D6R8Y8 96 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF575Q86XF7 245 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.66□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM219Q86XT9 240 aa12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms