RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 HPGDSO60760 199 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 NMBP08949 121 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC11BP0C7V7 166 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAIN1P0CW23 69 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 FHL2Q14192 279 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF546Q86UE3 836 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N976 141 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 BLNKQ8WV28 456 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 NRG4Q8WWG1 115 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 COX7A2P2O60397 106 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF253O75346 499 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV2-11P01706 119 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 CT45A10P0DMU9 189 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB31Q13636 194 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 TEPPQ6URK8 271 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZRG5 221 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SPXQ9BT56 116 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SRRQ9GZT4 340 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 PRELID1Q9Y255 219 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 KLLNB2CW77 178 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 FNDC10F2Z333 226 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4E1P0C645 316 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 OPCMLQ14982 345 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 GGTLC3B5MD39 225 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAC2D3DTV9 90 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS46E5RG02 174 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EPK0 472 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 CIDEAO60543 219 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 PITX3O75364 302 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-30P01768 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-33P01772 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 BTN1A1Q13410 526 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF846Q147U1 533 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf177Q52M58 125 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZRU5 148 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5SQ99766 215 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 MCUBQ9NWR8 336 aa5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BP45 60 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 CRISP2P16562 243 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 TGFBR1P36897 503 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 LELP1Q5T871 98 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 RASL10AQ92737 203 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF479Q96JC4 524 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 PFDN5Q99471 154 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 PSENENQ9NZ42 101 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR13Q9NZ81 148 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0D9SG52 128 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC17A3O00476 420 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-201ENST00000296642 AGPAT2O15120 278 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms