RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 FSHBP01225 129 aa6.3□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 IGHV4-59P01825 116 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 ID3Q02535 119 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 Q8NA96 180 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 LINC00477Q96M19 166 aa6.3□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 LINC01549A6NIU2 74 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.29□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.29□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 TOMM40O96008 361 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 IGLL1P15814 213 aa6.29□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 NOTCH2Q04721 2471 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TMEM89A2RUT3 159 aa6.29□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 ODF1Q14990 250 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 UTF1Q5T230 341 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 NRGNQ92686 78 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 C17orf98A8MV24 154 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP3-201ENST00000268049 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP3-201ENST00000268049 USF3Q68DE3 2245 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 C10orf142B7Z368 130 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 CRLF1O75462 422 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP3-201ENST00000268049 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP3-201ENST00000268049 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 XCL2Q9UBD3 114 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 AKAP6Q13023 2319 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 IGLL5B9A064 214 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 ATP6V0E1O15342 81 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 NPC2P61916 151 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 CEP350Q5VT06 3117 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 CACNA1DQ01668 2161 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 CREBBPQ92793 2442 aa6.26□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.26□□□□□ -1.41
USP3-201ENST00000268049 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.26□□□□□ -1.41
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