RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635893.1

SCN1A-211, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene SCN1A, Length 168 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-211ENST00000635893 ARPINQ7Z6K5 226 aa-1.43□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 SLC25A40Q8TBP6 338 aa-1.43□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-1.43□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 COL24A1Q17RW2 1714 aa-1.43□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 OBSL1O75147 1896 aa-1.43□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 F5P12259 2224 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 ERICH2A1L162 156 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 LRRN3E7EW58 273 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 SULT1C4O75897 302 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 HAND1O96004 215 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 TNNC2P02585 160 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 SKP1P63208 163 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 MED21Q13503 144 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 XAF1Q6GPH4 301 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 C22orf39Q6P5X5 142 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 S100A7AQ86SG5 101 aa-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 ACACAQ13085 2346 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 DNAH11Q96DT5 4516 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 TRAV27A0A087WT01 109 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 TNFP01375 233 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 AP3S2P59780 193 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 COX6A2Q02221 97 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 IMUPQ9GZP8 106 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 ARL5AQ9Y689 179 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-1.46□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 A0A0J9YY99 117 aa-1.46□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 A8MT66 165 aa-1.46□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 IGHV3-33P01772 117 aa-1.46□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 OR10J4P0C629 311 aa-1.46□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 ETV6P41212 452 aa-1.46□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 Q6Q795 121 aa-1.46□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.46□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 NCOA1Q15788 1441 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 A0A096LPI6 279 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 A6NN06 94 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 J3QRK9 145 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 SLC16A4O15374 487 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 OCM2P0CE71 109 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 RAB5CP51148 216 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 VBP1P61758 197 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 MIR22HGQ0VDD5 57 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 HYLS1Q96M11 299 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 RNF122Q9H9V4 155 aa-1.47□□□□□ -2.64
SCN1A-211ENST00000635893 LYSTQ99698 3801 aa-1.47□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 LAMB1P07942 1786 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 DCTN3O75935 186 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 TTRP02766 147 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 EVI2AP22794 236 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 RANP62826 216 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 OR2F1Q13607 317 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 HIST3H3Q16695 136 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 OR5D16Q8NGK9 328 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 CT55Q8WUE5 264 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 YPEL2Q96QA6 119 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 TVP23BQ9NYZ1 205 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 A0A0C4DFX4 3053 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.48□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 CHP2O43745 196 aa-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 CNIH1O95406 144 aa-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 DEXIO95424 95 aa-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 DEFA5Q01523 94 aa-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 TMED1Q13445 227 aa-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 FOXI2Q6ZQN5 318 aa-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 ITPR2Q14571 2701 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 TGOLN2O43493 480 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 MYL5Q02045 173 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 CNPY4Q8N129 248 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 LRRC18Q8N456 261 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 PPTC7Q8NI37 304 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 C8orf76Q96K31 380 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 NPCDR1Q9BY65 106 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 UQCC1Q9NVA1 299 aa-1.5□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 TANC1Q9C0D5 1861 aa-1.51□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 hADV38S2A0JD32 116 aa-1.51□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 IGHV3-30P01768 117 aa-1.51□□□□□ -2.65
SCN1A-211ENST00000635893 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-1.51□□□□□ -2.65
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