RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629846.2

PFKM-232, Transcript of phosphofructokinase, muscle, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PFKM, Length 381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKM-232ENST00000629846 TPPP3Q9BW30 176 aa5.56□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.56□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.56□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.56□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.56□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.56□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 G3V318 75 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 NDUFA4O00483 81 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 OVOL1O14753 267 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ARL3P36405 182 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 CRIP1P50238 77 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ZNF138P52744 262 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 TWIST1Q15672 202 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 PSMG4Q5JS54 123 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ORMDL3Q8N138 153 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 C8orf49Q96NF6 230 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 U3KQE9 123 aa5.55□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 A6NDX4 124 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 J3QLI3 93 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 IGHG2P01859 326 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 CD33P20138 364 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 CKS2P33552 79 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 CACNG7P62955 275 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 LINC01559Q495D7 138 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 C16orf92Q96LL3 132 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 LINC00477Q96M19 166 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 PRELID3AQ96N28 172 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 VGLL1Q99990 258 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 U3KQK5 164 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 MGAQ8IWI9 3026 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 A0A1B0GV90 55 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 TMEM89A2RUT3 159 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 C2orf70A6NJV1 201 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 IGLC3P0DOY3 106 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 CTRLP40313 264 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 FBLN7Q53RD9 439 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 Q6ZN92 141 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 TMEM219Q86XT9 240 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 Q8N976 141 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 CCDC140Q96MF4 163 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ST20Q9HBF5 79 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ZNF580Q9UK33 172 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PFKM-232ENST00000629846 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 OR4C46A6NHA9 309 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 LINC01548A6NM66 108 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 H3BUX3 64 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 K7EMT4 169 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 TCAPO15273 167 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 CSN3P07498 182 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 IGLC6P0CF74 106 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 PF4V1P10720 104 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 COX6B1P14854 86 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 ID1P41134 155 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 TDRG1Q3Y452 100 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 PIFOQ8TCI5 191 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.52□□□□□ -1.53
PFKM-232ENST00000629846 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms