RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	IGLL5	B9A064	214 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	RRN3P1	Q2M238	152 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF253	O75346	499 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	NDUFB4	O95168	129 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	IFNA5	P01569	189 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179		M0R3E3	92 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	KIR3DS1	Q14943	382 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	DKK2	Q9UBU2	259 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	AZU1	P20160	251 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	CDKN1B	P46527	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179		Q5BKY6	102 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	LINC01587	Q99440	93 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	OR10J4	P0C629	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	ERCC8	Q13216	396 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	PDE6H	Q13956	83 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179		J3KRW8	73 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	HTN1	P15515	57 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	TSPO	P30536	169 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	TCTA	P57738	103 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	ICAM4	Q14773	271 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	RNF141	Q8WVD5	230 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	PRELID1	Q9Y255	219 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	OR7C2	O60412	319 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	TAS2R60	P59551	318 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	LEP	P41159	167 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	DAD1	P61803	113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	OXA1L	Q15070	435 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	AQP10	Q96PS8	301 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	HTN3	P15516	51 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	RAB2A	P61019	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	ODF3	Q96PU9	254 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-223	ENST00000629179	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179		H7BYZ3	331 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	M6PR	P20645	277 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	TAS2R45	P59539	299 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	VGLL1	Q99990	258 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179		A0A1W2PPV4	95 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	LYRM9	A8MSI8	78 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	DEFB130B	P0DP73	79 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	DEFB130A	P0DP74	79 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF266	Q14584	549 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-223	ENST00000629179	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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