RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	CR1	P17927	2039 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM213	A2RRL7	107 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINT2	O43291	252 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	CRLF1	O75462	422 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5AL1	P0C617	328 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	RPE	Q96AT9	228 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TM2D2	Q9BX73	214 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495		V9GYV3	84 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM13	P0DJ93	91 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	CT45A10	P0DMU9	189 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX29	Q8N6K0	151 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4C12	Q96R67	309 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	NPFF	O15130	113 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	MT-ATP8	P03928	68 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5G3	P48201	142 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TNP2	Q05952	138 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	WFDC2	Q14508	124 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	POU2AF1	Q16633	256 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BP45	60 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-69	P01742	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	CATR1	Q13166	79 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	GTSF1	Q8WW33	167 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	OSTC	Q9NRP0	149 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	RABAC1	Q9UI14	185 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	NOTCH1	P46531	2555 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SYNGR2	O43760	224 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TUSC2	O75896	110 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2J3	O76001	311 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	LEPROTL1	O95214	131 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PAX8	Q06710	450 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL16	Q0P5N6	197 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PLGLA	Q15195	96 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ETDB	Q3ZM63	59 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6AWC8	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	DDB2	Q92466	427 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ESM1	Q9NQ30	184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EN84	100 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PPY	P01298	95 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF6	P10767	208 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PRTN3	P24158	256 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZSR3	168 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf52	Q96A22	123 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SIRPD	Q9H106	197 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF134	P52741	427 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	XG	P55808	180 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	OR51H1	Q8NH63	302 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	MDFI	Q99750	246 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	C20orf78	Q9BR46	151 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PRX2	142 aa		5.72	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms