RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591004.1

SMIM22-208, Transcript of small integral membrane protein 22, human

TSL 3

Gene SMIM22, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMIM22-208	ENST00000591004	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	TAS2R45	P59539	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	KHDC3L	Q587J8	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004		A0A1W2PPV4	95 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004		M0R3E3	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	HBE1	P02100	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	M6PR	P20645	277 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	EMP1	P54849	157 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	ICAM4	Q14773	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004		G3V3Q6	166 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	CDKN1B	P46527	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	RAB2A	P61019	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	LCE6A	A0A183	80 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	ARPC5	O15511	151 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	JTB	O76095	146 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	TSPO	P30536	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	LINC01587	Q99440	93 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004		J3KRW8	73 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	LEP	P41159	167 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	ERCC8	Q13216	396 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004		Q6ZTC4	211 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	C11orf94	C9JXX5	98 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	MB	P02144	154 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	PRM2	P04554	102 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	CSN1S1	P47710	185 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	SERF2	P84101	59 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	ODF3	Q96PU9	254 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004		Q9H3A6	140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SMIM22-208	ENST00000591004	HTN1	P15515	57 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	LINC00477	Q96M19	166 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	TAAR5	O14804	337 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	TAS2R60	P59551	318 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	VGLL1	Q99990	258 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SMIM22-208	ENST00000591004	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.06	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms