RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589706.1

SMAD4-208, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-208	ENST00000589706	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706		V9GYV3	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		F5H768	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TNFSF12	O43508	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	B4GALT1	P15291	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ORM2	P19652	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	OPRK1	P41145	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SSR2	P43308	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PMVK	Q15126	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SP6	Q3SY56	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A1B0GWB2	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SNCG	O76070	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	MPV17	P39210	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	DLX6	P56179	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		Q6P435	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RDH5	Q92781	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ASCL2	Q99929	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SPTB	P11277	2137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A1W2PPV9	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGLL5	B9A064	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TNFSF11	O14788	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SYNGR2	O43760	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	NAPSA	O96009	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PPY	P01298	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SP1	P08047	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SPINT3	P49223	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HES1	Q14469	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	SEC16A	O15027	2179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706		C9JAW5	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	LINC01619	G3V211	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	OVOL3	O00110	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMAD4-208	ENST00000589706	PDCD6	O75340	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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