RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565362.5

PDXDC1-211, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-211ENST00000565362 C2orf50Q96LR7 162 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ATG101Q9BSB4 218 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 H3BTX0 84 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF253O75346 499 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CST7O76096 145 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 HTN1P15515 57 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 BCAP31P51572 246 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CAV2P51636 162 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 GUK1Q16774 197 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 MIC13Q5XKP0 118 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 RNF141Q8WVD5 230 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ODF3Q96PU9 254 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 MUC4Q99102 2169 aa7.5□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 C5orf51A6NDU8 294 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM25EA8MYX2 175 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 NUDT3O95989 172 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CT45A10P0DMU9 189 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 S100A11P31949 105 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 SULT1A1P50225 295 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CCL18P55774 89 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 PFDN5Q99471 154 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 NUDT15Q9NV35 164 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.49□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 IGSF23A1L1A6 192 aa7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF503Q96F45 646 aa7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CCDC32Q9BV29 185 aa7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.48□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 LEPP41159 167 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TNP2Q05952 138 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 RAB32Q13637 225 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ATP6V1FQ16864 119 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF575Q86XF7 245 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 C6orf223Q8N319 242 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.47□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 H3BNG1 76 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 M0R3E3 92 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 MPDU1O75352 247 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 NDUFB4O95168 129 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 M6PRP20645 277 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 HOXA5P20719 270 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 S100A10P60903 97 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 HBG1P69891 147 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 HBG2P69892 147 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 BAXQ07812 192 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 PDE6HQ13956 83 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 SSX7Q7RTT5 188 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 STX12Q86Y82 276 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 C18orf15Q96N68 181 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 PRELID1Q9Y255 219 aa7.46□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GAGE12BA1L429 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 SNURFLB1AK76 121 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 KLLNB2CW77 178 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 J3KRW8 73 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GAGE7O76087 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 RLN2P04090 185 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GAGE12FP0CL80 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GAGE12GP0CL81 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GAGE12IP0CL82 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 FGF7P21781 194 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 OR5I1Q13606 314 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 CLINT1Q14677 625 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00477Q96M19 166 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.1 ms