RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		14.37	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PRR25	Q96S07	402 aa		14.37	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	RAB9A	P51151	201 aa		14.36	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01545	Q5VT33	79 aa		14.36	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		14.36	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SIRPD	Q9H106	197 aa		14.36	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559		U3KQK5	164 aa		14.36	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGF2R	P11717	2491 aa		14.36	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-23	P01764	117 aa		14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	RAX	Q9Y2V3	346 aa		14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ORMDL3	Q8N138	153 aa		14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N9W7	124 aa		14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF747	Q9BV97	191 aa		14.35	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	hDV102S1	A0JD36	115 aa		14.34	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2E1	P51965	193 aa		14.34	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	KLK9	Q2XQG4	91 aa		14.34	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		14.34	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		14.34	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		14.33	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559		D6R8Y8	96 aa		14.33	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF738	Q8NE65	137 aa		14.33	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PRELID3A	Q96N28	172 aa		14.33	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		14.33	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		14.32	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		14.32	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	COX11	Q9Y6N1	276 aa		14.32	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf32	Q32M92	178 aa		14.32	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		14.32	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		14.32	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087X0K7	114 aa		14.31	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM213	A2RRL7	107 aa		14.31	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		14.31	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		14.31	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	GOSR1	O95249	250 aa		14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	AMN1	Q8IY45	258 aa		14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	VGLL1	Q99990	258 aa		14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559		H0Y8G0	127 aa		14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	IGHG4	P01861	327 aa		14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	GPR183	P32249	361 aa		14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ATRX	P46100	2492 aa		14.3	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	IGLC6	P0CF74	106 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	EFNA4	P52798	201 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RHOG	P84095	191 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TWIST1	Q15672	202 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RBAKDN	A6NC62	111 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ECSCR	Q19T08	205 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559		Q8TAT8	98 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		14.29	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	BUB3	O43684	328 aa		14.28	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC3B	P05452	202 aa		14.28	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CKS2	P33552	79 aa		14.28	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	DPF1	Q92782	380 aa		14.28	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		14.28	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		14.27	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	14.27	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	MPV17L2	Q567V2	206 aa		14.27	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CNFN	Q9BYD5	112 aa		14.27	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		14.27	□□□□□ -0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V0E1	O15342	81 aa		14.27	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SAA4	P35542	130 aa		14.27	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	AJUBA	Q96IF1	538 aa		14.27	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	RELN	P78509	3460 aa		14.27	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TCF21	O43680	179 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT3	O95989	172 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	HBD	P02042	147 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ORM1	P02763	201 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PPBP	P02775	128 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PTTG1IP	P53801	180 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559		A0A096LNJ9	63 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFS7	O75251	213 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2V1	Q13404	147 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	14.26	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		14.25	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		14.25	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPR1	153 aa		14.25	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	COX8A	P10176	69 aa		14.25	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DMB	P28068	263 aa		14.25	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		14.25	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		14.25	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		14.25	□□□□□ -0.13
RRN3-205	ENST00000563559	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		14.25	□□□□□ -0.13

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