RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540719.1

QKI-211, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, humanhuman

TSL 2

Gene QKI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKI-211ENST00000540719 CCSO14618 274 aa6.1□□□□□ -1.43
QKI-211ENST00000540719 ZNF253O75346 499 aa6.1□□□□□ -1.43
QKI-211ENST00000540719 SCGB1D2O95969 90 aa6.1□□□□□ -1.43
QKI-211ENST00000540719 TCRBP04435 133 aa6.1□□□□□ -1.43
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QKI-211ENST00000540719 CT45A10P0DMU9 189 aa6.1□□□□□ -1.43
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QKI-211ENST00000540719 RHOBP62745 196 aa6.1□□□□□ -1.43
QKI-211ENST00000540719 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.1□□□□□ -1.43
QKI-211ENST00000540719 C6orf223Q8N319 242 aa6.1□□□□□ -1.43
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QKI-211ENST00000540719 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.1□□□□□ -1.43
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QKI-211ENST00000540719 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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QKI-211ENST00000540719 MIC13Q5XKP0 118 aa6.09□□□□□ -1.43
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QKI-211ENST00000540719 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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QKI-211ENST00000540719 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.08□□□□□ -1.44
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QKI-211ENST00000540719 SSX7Q7RTT5 188 aa6.08□□□□□ -1.44
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QKI-211ENST00000540719 Q9H3A6 140 aa6.08□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 Q9H8V8 135 aa6.08□□□□□ -1.44
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QKI-211ENST00000540719 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.07□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 C2orf50Q96LR7 162 aa6.07□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.07□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 NUDT15Q9NV35 164 aa6.07□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.07□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 A0A096LPF7 62 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.06□□□□□ -1.44
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QKI-211ENST00000540719 J3QL48 77 aa6.06□□□□□ -1.44
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QKI-211ENST00000540719 GAGE12FP0CL80 117 aa6.06□□□□□ -1.44
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QKI-211ENST00000540719 GAGE12IP0CL82 117 aa6.06□□□□□ -1.44
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QKI-211ENST00000540719 VAMP2P63027 116 aa6.06□□□□□ -1.44
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QKI-211ENST00000540719 Q6ZRG5 221 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 Q6ZTI0 123 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 PFDN5Q99471 154 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
QKI-211ENST00000540719 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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