RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 RNF24Q9Y225 148 aa13.4□□□□□ -0.26
TSTA3-211ENST00000529899 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TSTA3-211ENST00000529899 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.39□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 HBE1P02100 147 aa13.39□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 AZU1P20160 251 aa13.39□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.39□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.39□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.39□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 APLNQ9ULZ1 77 aa13.39□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 TRAV10A0A0B4J240 114 aa13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 J3KRW8 73 aa13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PET100P0DJ07 73 aa13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 RRN3P1Q2M238 152 aa13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 MED28Q9H204 178 aa13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 DKK2Q9UBU2 259 aa13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 OR10J4P0C629 311 aa13.37□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ERCC8Q13216 396 aa13.37□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.37□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF503Q96F45 646 aa13.37□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.37□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.36□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.36□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 C11orf94C9JXX5 98 aa13.36□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 AMBPP02760 352 aa13.36□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CT45A10P0DMU9 189 aa13.36□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM189A5PLL7 270 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 GUK1Q16774 197 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 FXYD5Q96DB9 178 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 FUT9Q9Y231 359 aa13.35□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 VPS13DQ5THJ4 4388 aa13.34□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF253O75346 499 aa13.34□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 HTN1P15515 57 aa13.34□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CDKN1BP46527 198 aa13.34□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.34□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 LINC01587Q99440 93 aa13.34□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 TIMM9Q9Y5J7 89 aa13.34□□□□□ -0.27
TSTA3-211ENST00000529899 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 IFNA5P01569 189 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 HTN3P15516 51 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ICAM4Q14773 271 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 PAXXQ9BUH6 204 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 OR51M1Q9H341 326 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.33□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 RAB2AP61019 212 aa13.32□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 KMT2AQ03164 3969 aa13.32□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 OR7C2O60412 319 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 RNF141Q8WVD5 230 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 VGLL1Q99990 258 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 PDE6HQ13956 83 aa13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 RGS21Q2M5E4 152 aa13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 Q6ZQT7 251 aa13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 G3V3Q6 166 aa13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 GIPP09681 153 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 TAS2R60P59551 318 aa13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 OXA1LQ15070 435 aa13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 PRR9Q5T870 116 aa13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 AQP10Q96PS8 301 aa13.29□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 DEFB130BP0DP73 79 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 DEFB130AP0DP74 79 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 DAD1P61803 113 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 CD300CQ08708 224 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 BTN1A1Q13410 526 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 Q8TAT8 98 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SH3BGRL3Q9H299 93 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-211ENST00000529899 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RNF222A6NCQ9 220 aa13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TSPOP30536 169 aa13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 LEPP41159 167 aa13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RANP62826 216 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ODF3Q96PU9 254 aa13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 PRELID1Q9Y255 219 aa13.27□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SMLR1H3BR10 107 aa13.26□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 H7BYZ3 331 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.5 ms