RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 KIR3DS1Q14943 382 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF575Q86XF7 245 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 NPBQ8NG41 125 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 S4R3C0 116 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 F8W735 103 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 SMKR1H3BMG3 65 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 K7EP34 96 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFA3O95167 84 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 IGLC6P0CF74 106 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 CKS2P33552 79 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 AP1S3Q96PC3 154 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 LINC01546A6NGU7 62 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 H3BUT2 72 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 MFAP4P55083 255 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 PIFOQ8TCI5 191 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 CFHR4Q92496 578 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 CSTL1Q9H114 145 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 LAMA5O15230 3695 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0G2JLM5 398 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 TWIST1Q15672 202 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 PCP2Q8IVA1 136 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 SAP30O75446 220 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 RNF185Q96GF1 192 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 DKK2Q9UBU2 259 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 ZZEF1O43149 2961 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 BMI1P35226 326 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 TCTAP57738 103 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 CNFNQ9BYD5 112 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 DPM3Q9P2X0 92 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 IGHG4P01861 327 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 NMUP48645 174 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 VGLL1Q99990 258 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 BSNQ9UPA5 3926 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1W2PRD5 423 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1W2PRF3 423 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1W2PRM7 423 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 Q8TAT8 98 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 ZMAT4Q9H898 229 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1W2PPM0 123 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 PSMG4Q5JS54 123 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 CACNA1HO95180 2353 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 G3V4G9 280 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 CD3EP07766 207 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 CEACAM3P40198 252 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 MGAQ8IWI9 3026 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 CEP250Q9BV73 2442 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 FCER1GP30273 86 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 ODF1Q14990 250 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 Q8NA96 180 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 RAB37Q96AX2 223 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 HIGD1BQ9P298 99 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 KALRNO60229 2985 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 GAS8-AS1O95177 125 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 NDPQ00604 133 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 ARPC1AQ92747 370 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 C18orf15Q96N68 181 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 ODF3BA8MYP8 253 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 HLA-DMBP28068 263 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-217ENST00000524534 LEPP41159 167 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms